Microsoft en open standaarden zijn in de ogen van velen niet een logische twee-eenheid. Met de komst van de nieuwe integratieserver van Microsoft, BizTalk 2004, kon dat beeld wel eens gaan veranderen. Dit product ondersteunt een indrukwekkende lijst aan open standaarden, waarmee Microsoft een nieuwe weg lijkt in te slaan voor wat betreft applicatie-integratie. In tegenstelling tot de vorige twee versies van BizTalk, lijkt BizTalk 2004 geen poging van Microsoft om eigen 'standaarden' te pushen. In BizTalk 2004 worden open standaarden ondersteund en gebruikt in alle vier lagen van de zogenaamde integratie-stack.